Le cause di disapplicazione automatica della disciplina delle società di comodo non devono essere necessariamente applicate dal contribuente. Relativamente alle cause di disapplicazione parziale che hanno ad oggetto partecipazioni, potrebbe accadere che il contribuente non abbia interesse a farle valere: data la necessità di escludere dal test di operatività tanto la partecipazione quanto i correlati dividendi, in determinati casi il contribuente potrebbe non essere di comodo ma diventarlo proprio a causa dell'applicazione letterale della causa di disapplicazione.