Il DM 7.8.2025, attuativo degli artt. 93 e 96 del D.lgs. 117/2017 e relativo ai controlli ordinari e straordinari sugli enti iscritti al RUNTS, è stato pubblicato sulla Gazzetta Ufficiale 15.9.2025 n. 214. In linea generale, i controlli vengono effettuati per verificare:
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la sussistenza e la permanenza dei requisiti ai fini della iscrizione dell'ente al RUNTS,
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il perseguimento delle finalità civiche, solidaristiche e di utilità sociale,
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l'adempimento degli obblighi derivanti dall'iscrizione al RUNTS.
I controlli ordinari hanno cadenza triennale, mentre quelli straordinari sono disposti dall'Ufficio del RUNTS, sulla base di esigenze di approfondimento derivanti dagli esiti dei controlli ordinari, o di atti o fatti ritenuti rilevanti di cui sia venuto a conoscenza, anche su segnalazione di altre amministrazioni.