L'art. 1 co. 5 lett. b-bis) del D.lgs. 127/2015 prevede che i file delle fatture elettroniche acquisiti tramite il Sistema di Interscambio sono memorizzati al fine di essere utilizzati, fra l'altro, dall'Agenzia delle Dogane e dei Monopoli per le attività di vigilanza e di controllo ex art. 18 del D.lgs. 504/95 (TUA) nel settore delle accise. Gli Autori rilevano che lo schema del D.lgs. correttivo "Omnibus" della Riforma fiscale estende l'utilizzabilità di tali file anche per le attività di analisi dei rischi e di controllo a fini fiscali e doganali nelle materie e attività di competenza dell'Agenzia delle Dogane e dei Monopoli.